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論文專著：

發表論文580余篇，其中SCI檢索的論文120余篇；主編、參編、主譯全國統編教材、專著16本。

出版專著：

1． 《給水排水工程計算機程序設計》，彭永臻主編，崔福義編著，中國建筑工業出版社，1996。

2． 《環境工程手冊》，彭永臻參編，高等教育出版社出版，1996。

3． 《給水排水工程儀表與控制》，崔福義，彭永臻，中國建筑工業出版社，1999。

4． 《水質工程實驗技術》，彭永臻主審，黑龍江教育出版社，2000。

5． 《給水排水工程計算機應用》，彭永臻主編，中國建筑工業出版社，建設部“九五”重點立項教材（代碼為JS018），2002。

6． 《微生物與水處理工程》，李軍，楊秀山，彭永臻，化學工業出版社，2002。

7． 《環境導論》，彭永臻主審，王淑瑩，高春娣，中國建筑工業出版社，2004。

8． 《污水處理系統的建模、診斷和控制》，高景峰，彭永臻，化學工業出版社，2005。

9． 《生物除磷的設計與運行手冊》，祝貴兵，彭永臻，中國建筑工業出版社，2005。

10． 《水質工程學》，李圭白、張杰，彭永臻，崔福義，中國建筑工業出版社，2005。

11． 《新英漢給水排水辭典》，彭永臻參編，中國建筑工業出版社，2005。

12． 《給水排水工程儀表與控制》，崔福義，彭永臻，南軍，中國建筑工業出版社，2006。

13． Frontiers in Environmental Research，chapter 1“The Optimization and Control of Pre-denitrification Process to Improve Nitrogen Removal”，Ma Yong，Peng Yongzhen，etc.  Nova Science Publishers of America 2006。

14． 《城市污水處理系統的運行與過程控制》，馬勇，彭永臻，科學出版社，獲2007年度國家科學技術學術著作出版基金，2007。

15． 《污水處理系統的儀表、控制和自動化》，馬勇，彭永臻，中國建筑工業出版社，2007。

16． 《A2O法污水生物脫氮除磷處理技術與應用》，王曉蓮，彭永臻，科學出版社 2009。

17． 《序批式活性污泥法原理與應用》，楊慶， 彭永臻編著，科學出版社，2010。

18． 《污水處理顆粒污泥技術原理與應用》，吳昌永，王然登，彭永臻編著,，中國建筑工業出版社，2011。

19． 《SBR法污水生物脫氮除磷及過程控制》，彭永臻著，科學出版社，2011。

20． 《活性污泥膨脹機理、成因及控制》，彭永臻著，郭建華編著，科學出版社，2012。

發表英文論文：

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發表中文會議論文：

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