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科學研究：

研究方向：

主要從事計算化學生物學的研究。

承擔科研項目情況：

承擔或參與國家自然科學基金委、科技部、中國科學院以及上海市科委在研項目多項。

1． 國家自然科學基金委青年科學基金一項，2006-2008。

2． 中國科學院優秀博士學位論文科研啟動專項資金一項，2006-2008。

資料更新中……

科研成果：

1． 分子靶向藥物設計方法的研究及應用，2010年獲藥明康德“生命化學研究獎”三等獎。

資料更新中……

發明專利：

1． 一類磷脂酶甲2的抑制劑及其制備方法和用途 來魯華; 馮亞兵; 劉瑩; 王任小; 周廣彥 【中國專利】北京大學 2002-07-10

2． 一種噻唑聯吡唑酮類化合物及其作為Bcl-2家族蛋白拮抗劑的應用 王任小; 馬大為; 李勛; 孫威; 周炳城; 石志敏; 張興龍; 朱翠俠; 李雯雯 【中國專利】中國科學院上海有機化學研究所 2009-01-14

3． 一種噻唑并[3,2-a]嘧啶類化合物及其作為Bcl-2家族蛋白拮抗劑的應用 王任小; 俞飚; 李勛; 周炳城; 石志敏; 張興龍; 朱翠俠; 李雯雯 【中國專利】中國科學院上海有機化學研究所 2009-01-21

4． 2-芳基-6-芳基’-葡萄糖苷類化合物及其制備方法與應用 王任小; 俞飚; 史合方; 李勛; 周炳城; 李嫣; 石志敏; 張興龍; 朱翠俠; 李雯雯 【中國專利】中國科學院上海有機化學研究所 2009-01-21

5． 芳香胺類衍生物或其類似物及其應用 葉德泳; 王任小; 張亞; 林賦; 鄧曉東; 李勛; 周璐; 鄭雪雁 復旦大學; 【中國專利】復旦大學; 中國科學院上海有機化學研究所 2011-03-30

計算機軟件著作權申請：

1. 中科院上海有機化學研究所，化學結構自動識別軟件I-interpret v1.0，登記號：2007SR15399.

2. 中科院上海有機化學研究所，脂水分配系數預測軟件XLOGP v3.0，登記號：2008SR05200.

3. 中科院上海有機化學研究所，蛋白-配體復合物親合性PDBbind-CN數據庫系統 v2008，登記號：2008SR34921.

4. 中科院上海有機化學研究所，分子設計ITMD軟件 v1.0，登記號：2008SR34922.

5. 中科院上海有機化學研究所，蛋白-配體親合性預測X-SCORE軟件 v2.0，登記號：2008SR34923.

6. 中科院上海有機化學研究所，先導化合物的發現及結構優化軟件AT&T v1.0，登記號：2009SR061028.

7. 中科院上海有機化學研究所，CCBG-CMS化合物管理系統軟件v1.0，登記號：2009SR061029.

論文專著：

發表學術論文80余篇。

出版專著：

資料更新中……

發表英文論文：

1. Li, Y.; Liu, Z.; Wang, R.*, “Test MM-PB/SA on True Conformational Ensembles of Protein-Ligand Complexes”, J. Chem. Inf. Model. 2010, 50, 1682-1692.

2. Lin, F.; Wang, R.*, “Systematic Derivation of AMBER Force Field Parameters Applicable to Zinc”, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 1852-1870.

3. Cheng, T.; Liu, Z.; Wang, R.*, “A Knowledge-Based Strategy for Improving the Accuracy of Scoring Functions in Binding Affinity Prediction”, BMC Bioinformatics, 2010, 11, 193-208.

4. Li, X.; Li, Y.; Cheng, T.; Liu, Z.; Wang, R.*, “Evaluation of the Performance of Four Molecular Docking Programs on a Diverse Set of Protein-Ligand Complexes”, J. Comp. Chem. 2010, 31, 2109-2125.

5. Shi, H.; Zhou, B.; Li, W.; Shi, Z.; Yu, B.*; Wang, R.*, "Synthesis and Anti-tumor Activities of Methyl 2-O-Aryl-6-O-Aryl’-D-Glucopyranosides", Bioorg. Med. Chem. Lett., 2010, 20, 2855-2858.

6. Li, X.; Liu, Z.; Li, Y.; Li, J.; Li, J.; Wang, R.*, “A Statistical Survey on the Binding Constants of Covalently Bound Protein-Ligand Complexes”, Mol. Informatics, 2010, 29, 87-96.

7. Zheng, F.; Lin, F.; Wang, R.; Qing, F.-L. “Synthesis and conformational analysis of D-2-deoxy-2,2-difluoro-4-dihydro-4-thionucleosides”, Org. Biomol. Chem., 2010, 8, 163-170.

8. Lin, F.; Wang, R.* “Hemolytic Mechanism of Dioscin Proposed by Molecular Dynamics Simulations”, J. Mol. Model. 2010, 16, 107-118.

9. Cheng, T.; Li, X.; Li, Y.; Liu, Z.; Wang, R.* “Comparative Assessment of Scoring Functions on a Diverse Test Set”, J. Chem. Inf. Model. 2009, 49, 1079-1093.

10. Zhang, X.; Li, X.; Wang, R.* “Interpretation of the Binding Affinities of PTP1B Inhibitors with the MM-GB/SA method and the X-Score Scoring Function”, J. Chem. Inf. Model. 2009, 49, 1033-1048. (cover story)

11. Li, Y.; Zhou, B.; Wang, R.* “Rational Design of Tamiflu Derivatives Targeting at the Open Conformation of Neuraminidase Subtype 1”, J. Mol. Graph. Model. 2009, 28, 203-219.

12. Li, X.; Wang, R.* “Automatic Identification of Antibodies in the Protein Data Bank”, Chinese Journal of Chemistry, 2009, 27, 23-28.

13. Wang, K.; Wu, Y.-S.; Wang, G.-T.; Wang, R.-X.; Jiang, X.-K.; Fu, H.-B.; Li, Z.-T., "Hydrogen bonding-mediated foldamer-bridged zinc porphyrin-C60 dyads: ideal face-to-face orientation and tunable donor–acceptor interaction", Tetrahedron, 2009, 65, 7718–7729.

14. Zhu, Y.-Y.; Wang, G.-T.; Wang, R.-X.; Li, Z.-T. "Intramolecular Six-Membered and Three-Center C-H-O Hydrogen Bonding in 1,4-Diphenyl-1,2,3-Triazoles", Cryst. Growth Des., 2009, 9, 4778–4783.

15. Liu, Z. G.; Wang, G. T.; Li, Z. T.; Wang, R.* “Geometrical Preferences of the Hydrogen Bonds on Protein-Ligand Binding Interface Derived from Statistical Surveys and Quantum Mechanics Calculations”, J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1959–1973.

16. Lin, F.; Wang, R.* “Molecular modeling of the three-dimensional structure of GLP-1R and its interactions with several agonists”, J. Mol. Model. 2008, 15, 53-65.

17. Cai, W.; Wang, G. T.; Du, P.; Wang, R. X.; Jiang, X. K.; Li, Z.T.* “Foldamer Organogels: A Circular Dichroism Study of Glucose-Mediated Dynamic Helicity Induction and Amplification”, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 13450–13459.

18. Yeang, C.; Varshney, S.; Wang, R.; Zhang Y.; Ye D.Y.; Jiang, X. C.* “The domain responsible for sphingomyelin synthase (SMS) activity”, Biochimica et Biophysica Acta-Molecular and Cell Biology of Lipids, 2008, 1781, 610-617.

19. Cheng, T.; Zhao, Y.; Li, X.; Lin, F.; Xu, Y.; Zhang, X.; Li, Y.; Wang, R.*; Lai, L. “Computation of Octanol-Water Partition Coefficients by Guiding an Additive Model with Knowledge”, J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 2140-2148.

20. Zhao, Y.; Cheng, T.; Wang, R.* “Automatic Perception of Organic Molecules Based on Essential Structural Information”, J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 1379-1385.

21. Wang, R.*; Lin, F.; Xu, Y.; Cheng, T. “I-SOLV: A new surface-based empirical model for computing solvation free energies”, J. Mol. Graph. Model. 2007, 26, 368-377.

22. Feng, D.-J.; Wang, G..-T.; Wu, J.; Wang, R.-X.; Li, Z.-T.* “Hydrogen bonding-driven elastic bis(zinc)porphyrin receptors for neutral and cationic electron-deficient guests with a sandwich-styled complexing pattern”, Tetrahedron Lett. 2007, 48, 6181-6185.

23. Li, C.; Wang, G.; Yi, H.; Jiang, X.; Li, Z.*; Wang, R.* “Diastereomeric Recognition of Chiral Foldamer Receptors for Chiral Glucoses”, Org. Lett. 2007, 9, 1797-1800.

24. Ma, D.*; Yu, S.; Li, B.; Chen, L.; Chen, R.; Yu, K.; Zhang, L.; Chen, Z.; Zhong, D.; Gong, Z.; Wang, R.; Jiang, H.; Pei, G. “Synthesis and Biological Evaluation of 1,3,3,4-Tetrasubstituted Pyrrolidine CCR5 Receptor Antagonists. Discovery of a Potent and Orally Bioavailable Anti-HIV Agent”, ChemMedChem, 2007, 2, 187-193.

25. Tang, G.; Ding, K.; Nikolovska-Coleska, Z.; Yang, C.-Y.; Qiu, S.; Shangary, S.; Wang, R.; Guo, J.; Gao, W.; Meagher, J.; Stuckey, J.; Krajewski, K.; Jiang, S.; Roller, P. P.; Wang, S.* “Structure-Based Design of Flavonoid Compounds As a New Class of Small-Molecule Inhibitors of the Anti-apoptotic Bcl-2 Proteins”, J. Med. Chem. 2007, 50, 3163-3166.

26. Tang, G.-Z.; Yang, C.-Y.; Nikolovska-Coleska, Z.; Guo, J.; Qiu, S.; Wang, R. X.; Gao, W.; Wang, G.-P.; Stuckey, J.; Krajewski, K.; Jiang, S.; Roller, P. P.; Wang, S. M.* “Pyrogallol-based molecules as potent inhibitors of the antiapoptotic Bcl-2 proteins”, J. Med. Chem. 2007, 50, 1723-1726.

27. Lu, Y.; Wang, R.; Yang, C.-Y.; Wang, S.* “Analysis of ligand-bound water molecules in high-resolution crystal structures of protein-ligand complexes”. J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 668-675.

28. Zhang M.C.; Ling, Y.; Yang, C.-Y.; Liu, H. P.; Wang, R. X.; Wu, X. H.; Ding, K.; Zhu, F.; Griffith, B. N.; Mohammad, R. M.; Wang, S. M.*; Yang, D. J. “A novel Bcl-2 small molecule inhibitor 4-(3-methoxy-phenylsulfannyl)-7-nitro-benzofurazan-3-oxide (MNB)-induced apoptosis in leukemia cells”. Annals. Hematology, 2007, 86, 471-481.

29. Xu, Y.; Wang, R.* “A Computational Analysis of the Binding Affinities of FKBP12 Inhibitors Using the MM-PB/SA Method”, Proteins, 2006, 64, 1058-1068.

30. Yu, S.; Pu, X.; Cheng, T.; Wang, R.; Ma, D.* “Total Synthesis of Clavepictines A and B and Pictamine”, Org. Lett. 2006, 8, 3179-3182.

31. Ma, D.*; Jiang, Y.; Chen, F.; Gong, L.-k.; Ding, K.; Xu, Y.; Wang, R.; Ge, A.; Ren, J.; Li, J.; Li, J.; Ye, Q. “Selective Inhibition of Matrix Metalloproteinase Isozymes and in Vivo Protection against Emphysema by Substituted -Keto Carboxylic Acids”, J. Med. Chem. 2006, 49, 456-458.

32. Wang, G.; Nikolovska-Coleska, Z.; Yang, C.-Y.; Wang, R.; Tang, G.; Guo, J.; Shangary, S.; Qiu, S.; Gao, W.; Yang, D.; Meagher, J.; Stuckey, J.; Krajewski, K.; Jiang, S.; Roller, P. P.; Abaan, H. O.; Tomita, Y.; Wang, S.* “Structure-Based Design of Potent Small-Molecule Inhibitors of Anti-Apoptotic Bcl-2 Proteins”, J. Med. Chem., 2006, 49, 6139-6142.

33. Yang, C.-Y.; Wang, R.; Wang, S.* “M-Score: A Knowledge-Based Potential Scoring Function Accounting for Protein Atom Mobility”, J. Med. Chem. 2006, 49, 5903-5911.

34. Wang, R.; Fang, X.; Lu, Y.; Yang, C.-Y.; Wang, S.* “The PDBbind Database: Methodologies and Updates”, J. Med. Chem. 2005, 48, 4111-4119.

35. Yang, C.-Y.; Wang, R.; Wang, S.* “A Systematic Analysis of the Effect of Small-Molecule Binding on Protein Flexibility of the Ligand-Binding Sites”, J. Med. Chem. 2005, 48, 5648-5650.

36. Song, H.; Wang, R.; Wang, S; Lin, J.* “A low-molecular-weight compound discovered through virtual database screening inhibits Stat3 function in breast cancer cells”, Proc. Natl. Acad. Sci. 2005, 102, 4700-4705.

37. Wang R.; Lu Y.; Fang X.; Wang S.* “An Extensive Test of 14 Scoring Functions Using the PDBbind Refined Set of 800 Protein-Ligand Complexes”, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 2114-2125.

38. Real P. J.; Cao, Y.; Wang R.; Nikolovska-Coleska Z.; Sanz-Ortiz J.; Wang S.; Fernandez-Luna J. L.* “Breast cancer cells can evade apoptosis-mediated selective killing by a novel small molecule inhibitor of Bcl-2”, Cancer Research, 2004, 64, 7947-7953.

39. Wang, R.; Fang, X.; Lu, Y.; Wang, S.* “The PDBbind Database: Collection of Binding Affinities for Protein-Ligand Complexes with Known Three-Dimensional Structures”, J. Med. Chem. 2004, 47, 2977-2980.

40. Nikolovska-Coleska, Z.; Wang, R.; Fang X, Wang, S.* “Development and optimization of a binding assay for the XIAP BIR3 domain using fluorescence polarization”, Analytical Biochemistry 2004, 332, 261-273.

41. Nikolovska-Coleska, Z.; Xu, L.; Hu, Z.; Tomita, Y.; Li, P.; Roller, P. P.; Wang, R.; Fang, X.; Guo, R.; Zhang, M.; Lippman, M. E.; Yang, D.; Wang, S.* “Discovery of Embelin as a Cell-Permeable, Small-Molecular Weight Inhibitor of XIAP through Structure-Based Computational Screening of a Traditional Herbal Medicine Three-Dimensional Structure Database”, J. Med. Chem. 2004, 47, 2430-2440.

42. Gao, Y.; Wang, R.; Lai, L.* “Structure-based method for analyzing protein-protein interfaces”, J. Mol. Model. 2004, 10, 44-54.

43. Wang, R.; Lu, Y.; Wang, S.* “Comparative Evaluation of Eleven Scoring Functions for Molecular Docking”, J. Med. Chem. 2003, 46, 2287-2303.

44. Leach, A. G.; Wang, R.; Wohlhieter, G. E.; Khan, S. I.; Jung, M. E.; Houk, K. N.* “Theoretical Elucidation of Kinetic and Thermodynamic Control of Radical Addition Regioselectivity”, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4271-4278.

45. Wang, R.; Lai, L.; Wang, S.* “Further development and validation of empirical scoring functions for structure-based binding affinity prediction”, J. Comput.-Aided Mol. Des. 2002, 16, 11-26.

46. Gao, Y.; Wang, R.; Lai, L.* “New method to analyze protein-protein interaction interface”, Acta Phys.-Chim. Sinica 2002, 18, 676-679.

47. Wang, R.; Wang, S.* “How does consensus scoring work for virtual library screening? An idealized experiment”, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2001, 41, 1422-1426.

48. Rong, S.; Hu, Y.; Enyedy, I.; Powis, G.; Meuillet, E. J.; Wu, X.; Wang, R.; Wang, S.*; Kozikowski, A. P. “Molecular Modeling Studies of the Akt PH Domain and Its Interaction with Phosphoinositides”, J. Med. Chem. 2001, 44, 898-908.

49. Chen, J.; Wang, R.; Taussig, M.; Houk, K. N.* “Quantitative Calculation of Antibody-Antigen Binding: Steroid-DB3 Binding Energies by the Linear Interaction Energy Method”, J. Org. Chem. 2001, 66, 3021-3026.

50. Liu, Y.; Feng, Y.; Wang, R.; Gao, Y.; Lai, L.* “Quinoline-4-acetamides as sPLAB2B Inhibitors”, Bioorgan. & Med. Chem. Lett. 2001, 11, 1639-1641.

51. Liu, Y.; Feng, Y.; Gao, Y.; Wang, R.; Lai, L.* “Structure-based design and synthesis of novel type quinoline as secretory PLA(2) inhibitors”, Acta Phys.-Chim. Sinica 2001, 59, 1751-1755.

52. Chen, J.; Deng, Q.; Wang, R.; Houk, K. N.*; Hilvert, D.* "Shape Complementarity, Binding Site Dynamics, and Transition State Stabilization: A Theoretical Study of Diels-Alder Catalysis by Antibody 1E9", ChemBioChem 2000, 1, 255-261.

53. Wang, R.; Gao, Y.; Lai, L.* "LigBuilder: A Multiple-Purposed Program for Structure-Based Drug Design", J. Mol. Model. 2000, 6, 498-516.

54. Wang, R.; Gao, Y.; Lai, L.* "Calculating Partition Coefficients by Atom-Additive Method", Perspective in Drug Discovery & Design. 2000, 19, 47-66.

55. Li, W.; Liang, S.; Wang, R.; Lai, L.*; Han, Y. "Exploring the Conformational Diversity of Loops on Conserved Frameworks", Protein Eng. 1999, 12, 1075-1086.

56. Tao, P.; Wang, R.; Lai, L*. "Calculating Partition Coefficients of Peptides by the Addition Method", J. Mol. Model. 1999, 5, 189-195.

57. Tao, P.; Wang, R.; Lai, L*. "Calculating Partition Coefficients of Peptides by Amino Acid Addition Model", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1999, 15, 449-453.

58. Zhu, B.*; Zhang, P.; Wang, R.; Liu, Z.; Lai, L. “Phase separation and crystallization in mixed monolayers of FC and HC surfactants”, Colloids & Surfaces A 1999, 157, 63-71.

59. Wang, R.; Liu, L.; Lai, L.*; Tang, Y. "SCORE: A New Empirical Method for Structure-Based Estimation of Binding Affinities", J. Mol. Model. 1998, 4, 379-394.

60. Wang, R.; Gao, Y.; Liu, L.; Lai, L.* "All-Orientation Search and All-Placement Search in Comparative Molecular Field Analysis", J. Mol. Model., 1998, 4, 276-283.

61. Wang, R.; Li, W.; Lai, L.*; Tang, Y. "Estimating the Binding Affinities for Enzyme-Ligand Complexes", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1998, 14, 826-832.

62. Wang, R.; Liu, L.; Lai, L.*; Tang, Y. "Studying the Structure-Affinity Relationship of Thrombin Inhibitors", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1998, 14, 887-892.

63. Wang, R.; Feng, Y.; Lai, L.*; Tang, Y. "Studying the Structure-Affinity Relationship of Indole-Based Inhibitors for Phospholipase A2", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1998, 14, 893-897.

64. Wang, R.; Gao, Y.; Liu, L.; Lai, L.* "Role of Compound Orientation in CoMFA Studies", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1998, 14, 1-4.

65. Wang, R.; Fu, Y.; Lai, L.* "A New Atom-Additive Method for Calculating Partition Coefficients", J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1997, 37, 615-621.

66. Liu, L.; Wang, R.; Lai, L.*; Li, C.* "3D-QSAR and Pharmacophore Modeling of Growth Hormone Secretagogues", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1997, 13, 1090-1096.

67. Wang, R.; Fu, Y.; Lai, L.* "A New Method for Calculating Partition Coefficients of Organic Compounds", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1997, 13, 1-4.

68. Luo, Z.; Wang, R.; Lai, L.* "RASSE: A new Method for Structure-Based Drug Design", J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1996, 36, 1187-1194.

69. Lai, L.*; Wang, R.; Tang, Y. "A New Model for Calculating logP for Organic Compounds", Acta Phys.-Chim. Sinica, 1994, 10, 963-965.

70. Wang, Y.; Li, J.; Wang, R.* "Computational Approaches to Estimate Octanol-Water Partition Coefficient and Water Solubility of Organic Compounds", Acta Phys.-Chim. Sinica (物理化學學報), 2010,26, 1742-1754

71. Li, Y.; Wang, R.* “Theoretical approaches to the prediction of the biological targets of small-molecular compounds based on chemogenomic information”, Chinese Bulletin of Life Sciences (生命科學), 2009, 21, 400-407

發表中文論文：

1 化合物的空間取向對CoMFA結果的影響 王任小; 高瀅; 劉亮; 來魯華 北京大學物理化學研究所 【期刊】物理化學學報 1998-01-15

2 酶-配體復合物親和性的計算 王任小; 李維忠; 來魯華; 唐有祺 北京大學物理化學研究所 【期刊】物理化學學報 1998-09-15

3 凝血酶抑制劑的結構與活性的關系 王任小; 劉亮; 來魯華; 唐有祺 北京大學物理化學研究所 【期刊】物理化學學報 1998-10-15

4 磷脂酶A_2吲哚類抑制劑的結構和活性關系 王任小; 馮亞彬; 來魯華; 唐有祺 北京大學物理化學研究所 【期刊】物理化學學報 1998-10-15

5 有機化合物脂水分配系數和溶解度的計算方法 王艷玲; 李婕; 王任小 中國科學院上海有機化學研究所; 生命有機化學國家重點實驗室 【期刊】物理化學學報 2010-07-15

6 三種Bcl-2家族蛋白的表達、純化及活性分析 朱翠俠; 李勛; 李雯雯; 石志敏; 周佳海; 王任小 中國科學院上海有機化學研究所生命有機化學國家重點實驗室 【期刊】生物醫學工程學雜志 2010-08-25

7 應用化學基因組信息預測小分子化合物的潛在生物靶標的理論方法 李嫣; 王任小 中國科學院上海有機化學研究所生命有機化學國家重點實驗室 【期刊】生命科學 2009-06-15

8 國內外生物信息學數據庫服務新進展 李維忠; 王任小; 林大威; 毛鳳樓; 韓玉真; 來魯華 北京大學物理化學研究所 【期刊】生物化學與生物物理進展 1999-02-25

9 用氨基酸加和法計算多肽的脂水分配系數 陶鵬; 王任小; 來魯華 北京大學物理化學研究所 【期刊】物理化學學報 1999-05-15

10 分析蛋白質-蛋白質相互作用界面的新方法 高瑩; 王任小; 來魯華 北京大學化學與分子工程學院物理化學研究所; 北京大學化學與分子工程學院物理化學研究所 分子動態與穩態結構國家重點實驗室; 分子動態與穩態結構國家重點實驗室; 北京100 【期刊】物理化學學報 2002-08-30

11 有機化合物脂水分配系數logP的計算 來魯華; 王任小; 唐有祺 北京大學物理化學研究所 【期刊】物理化學學報 1994-11-30

12 計算有機化合物脂水分配系數的新方法 王任小; 傅瑛; 來魯華 北京大學物理化學研究所 【期刊】物理化學學報 1997-01-30

13 促生長激素釋放素三維定量構效關系及藥效團模型 劉亮; 王任小; 來魯華; 李崇熙 北京大學化學與分子工程學院 【期刊】物理化學學報 1997-12-30

榮譽獎勵：

1． 2001年獲美國Cap CURE癌癥基金會Young Investigator Award。

2． 2001年獲中國教育部“全國優秀博士學位論文”獎。

3． 2006年獲上海市科委“浦江人才”獎。

4． 2006年入選中國科學院“百人計劃”擇優支持。

5． 2009年獲Eli Lilly公司亞洲優秀畢業研究生導師獎。

6． 2009年獲明治乳業生命科學獎。

7． 2009年獲中國藥學會-施維雅青年藥物化學家獎。

8． 2010年獲SCOPUS“青年科學之星”榮譽稱號。

9． 2010年獲藥明康德“生命化學研究獎”三等獎。

資料更新中……

媒體報道：

險峰縱然三千丈堅信自有登頂時——記中國科學院上海有機化學研究所課題組長王任小研究員

一個經濟實力雄厚、擁有13億人口的泱泱大國，醫藥產業的規模位居世界前列，但是創制新藥的能力卻與西方發達國家存在明顯差距，這是我國醫藥行業最大的隱痛。這種狀況深深地觸動了不少在生物醫藥領域前行的科研工作者，這其中就包括在中國科學院上海有機化學研究所工作的王任小研究員。王任小研究員目前為生命有機化學國家重點實驗室課題組長，博士生導師。目前他正領導著他的課題組，開展藥物分子設計以及化學生物學等方面的基礎研究。其研究成果為藥物分子設計提供了更先進的工具，對于提高我國新藥創制領域的整體技術水平，追趕世界先進水平都具有非常現實的意義。

王任小研究員于1989年保送入北京大學化學學院學習，于1994年獲得理學學士學位。同年保送為北京大學化學學院研究生，師從唐有祺院士，從事計算機輔助藥物分子設計方面的研究，于1999年7月獲得理學博士學位。1999年至2005年先后在美國加利福尼亞大學洛杉磯分校化學系、美國喬治敦大學醫學中心以及美國密西根大學醫學院進行博士后研究以及工作。

王任小于2005年入選中國科學院“百人計劃”，其后加入中國科學院上海有機化學研究所工作至今。之所以選擇回國工作，用王任小研究員的話說是懷抱著報效祖國的夢想以及對我國在新藥創制領域現狀的一種不甘心。回國之后，王任小研究員憑借扎實的學術功底、與國際水平接軌的豐富科研經驗以及中科院上海有機化學研究所先進的科研設備和技術條件，很快就領導課題組打開了局面，取得了豐碩的科研成果。

前沿學科閃耀科學光芒

當今隨著各種基礎學科的發展，新藥研發早已進入了理性藥物設計階段。與以往主要依靠盲目篩選發現活性化合物不同，合理藥物設計充分依據生物化學、酶學、分子生物學、遺傳學信息學以及計算化學等學科的研究成果，針對這些基礎研究中所揭示的包括酶、受體、離子通道及核酸等潛在的藥物作用靶點以及藥物作用的生理機制，通過參考內源性配體或活性天然產物的化學結構特征等方法，設計出合理的藥物分子。

計算機輔助藥物設計（computer-aideddrugdesign,CADD）的出現使得理性藥物設計取得了重大的突破。計算機輔助藥物設計是指借助計算機技術，依靠分子模擬、化學信息學和生物信息學等技術手段，對有機小分子配體與生物大分子受體相互作用、藥物分子的結構-活性關系、疾病的生物靶標分子的性質等進行計算、分析和預測，從而指導新型藥物的發現，減少盲目性，提高新藥研發的整體效率。該學科是化學、生物學、藥學、物理學以及計算機科學的交叉學科，對于研究者的專業基礎提出了極大的挑戰。該學科自20世紀80年代以來得到蓬勃發展，目前已經具備完整的體系。它為合理設計藥物分子提供了理論依據和方向，降低了藥物開發的成本，縮短了藥物開發的時間，在新藥研發中已經得到了醫藥工業界和學術界的廣泛應用，為人類攻克一些頑癥提供了新的思路和成功的希望。

王任小研究員在攻讀博士學位時就確定了計算機輔助藥物分子設計作為其研究主攻方向并堅持至今。王任小研究員擅長以分子模擬、生物信息學和化學信息學為手段，研究重要生物大分子的功能和機制以及有機小分子與生物大分子之間的相互作用。自參加科研工作十余年來，他主持發展了多種藥物分子設計中的關鍵方法，其中近年來的代表工作有：蛋白-配體親合性打分函數X-Score、有機化合物脂水分配系數計算方法XLOGP、先導化合物結構優化方法AT&T軟件和PDBbind-CN數據庫。這些成果已獲得國家計算機軟件著作權9項，擁有來自世界上三十多個國家超過4000名注冊用戶。這些用戶中許多來自國際上著名的大學、研究機構以及大型醫藥公司，形成了廣泛的國際影響。

另外，王任小研究員也具有豐富的藥物分子設計實踐經驗。他選擇與重大疾病過程相關的生物大分子作為靶標，運用計算機輔助藥物設計方法并結合必要的化學和生物實驗手段，設計可以有效調節這些靶標分子功能的有機小分子化合物，并成功獲得了多類具有活性的化合物，近年來申請國家發明專利6項。王任小研究員課題組已經初步建立了理論結合實踐的整體研究框架，并獲得了豐碩的科研成果。

勵精圖治催熟累累碩果

科研道路從來不是一帆風順的坦途，要想取得好的成績也絕不可能一蹴而就。王任小研究員深知“成功是99﹪的汗水加上1﹪的靈感”。在他所從事的基礎科學研究領域中就更是如此。他從不好高騖遠、貪圖虛名，而是奉獻科學，埋頭苦干，踏踏實實地走好每一步。為了一個好的構想，他可以廢寢忘食地在實驗室里潛心鉆研數周；為了論證一種可能，他可以不畏艱辛地驗證一次又一次。失敗了，不氣餒，總結教訓，重新再來；成功了，不滿足，汲取經驗，再攀高峰……

“寶劍鋒從磨礪出，梅花香自苦寒來。”多年的辛勤科研換來的是一系列豐碩的成果：王任小研究員已在Proc.Natl.Acad.Sci.,J.Am.Soc.Chem.,J.Med.Chem.,J.Chem.Inf.Model.等國際國內核心刊物上發表學術論文70余篇，合計被引用超過2700次，H指數為23。王任小研究員早在2001年就獲得過中國教育部頒發的“全國百篇優秀博士論文”獎，同年又獲得美國CapCURE基金會頒發的青年科學家獎。自回國在中科院上海有機化學研究所擔任課題組長開展科研工作以來，王任小研究員先后獲得了中科院“百人計劃”擇優支持以及上海市科委“浦江人才”計劃支持。

由于工作成績優異，近年來他又先后獲得了數項競爭性強的知名科研獎項。2009年王任小研究員獲得第十二屆中國藥學會“施維雅青年藥物化學獎”。中國藥學會“施維雅青年藥物化學獎”是由中國藥學會與法國施維雅研究院共同設立的，每年評選一次，旨在鼓勵中國優秀青年藥物化學工作者立足于中國國內，致力于中國新藥的研究。該獎設立十年多來，有力推動了我國優秀青年藥物化學工作者的健康成長和發展。2010年，王任小研究員獲得了“SCOPUS青年科學之星”獎項。SCOPUS尋找青年科學之星活動于2009年由中國科學院科學新聞雜志以及愛思唯爾公司科技部聯合設立，是近年來中國第一個圍繞40歲以下青年科學家舉辦的評選活動。該獎項的評審根據公開、公平、公正的原則，獎勵本年度授予環境科學、生命科學、信息科學、氣候變化科學以及材料科學領域共50名青年科學家。在本年度的評選中，王任小研究員入圍生命科學領域前三甲，榮獲“輝瑞青年科學之星成長獎”。同年王任小研究員又獲得了藥明康德“生命科學研究獎”，這同樣是份量很重的一個獎項。該獎項由我國生物醫藥界的旗艦級公司藥明康德新藥開發有限公司設立，獎勵在化學、生命科學、醫學、藥學及相關科技領域中的科學研究、技術創新與開發、研究成果推廣應用、實現高新技術產業化、科學技術普及等方面取得成果或者做出貢獻的在校或在職優秀青年科技人才。自2007年設立以來，該獎項每年評選一次。2010年該獎項頒發給17名我國在藥物化學領域中做出杰出貢獻的科學家。王任小研究員是這批獲獎者中比較年輕的，充分說明了他不俗的科研實力。

由于他的科研工作的廣泛國際影響，王任小研究員目前受邀擔任國際刊物《ChemMedChem》和《MolecularInformatics》的顧問編委，并擔任《J.Med.Chem.》《J.Chem.Theor.Comput.》《J.Chem.Inf.Model.》《Med.Res.Rev.》等近20種國內外核心學術期刊的審稿專家。他密切關注國際上相關研究的最新成果和動向，并在國內發表和傳播，沒有一絲懈怠。正是這種不斷進取、不斷開拓、永不止步的精神，使他的課題組可以取得追蹤甚至趕超國際先進水平的成果。

精英團隊共鑄“科研利艦”

談到取得的成績，王任小研究員謙虛地說：“我之所以能取得一點成績，真的全靠我的團隊”。王任小研究員領導的課題組由固定科研人員、博士后和研究生相結合組成，是一支年輕的、具有多學科專業知識的科研團隊。人才優勢是這個科研團隊的核心靈魂。目前王任小研究員課題組承擔以及參與多項國家自然科學基金委、科技部以及上海市科委的科研項目。在國家各級部門的資助以及各位成員的努力下，該課題組不懈進取，為我國藥物分子設計學科的發展貢獻著一份不可或缺的力量。

王任小研究員課題組目前擁有充足的計算機硬件資源以及一批與國際水平接軌的分子模擬軟件。在計算機硬件資源方面，課題組擁有Linux集群式服務器2套（>400CPU）以及一批高性能圖形桌面工作站。在藥物分子設計軟件方面，該課題組擁有齊全的主流商用軟件如Sybyl、DiscoveryStudio/PipelinePilot、Schrodinger、MOE、分子對接軟件GOLD、量子化學軟件Gaussian09以及MDL數據庫系統。MDL數據庫系統內容豐富，囊括了天然產物數據庫、中草藥成份數據庫、毒性數據庫、代謝數據庫、CMC、MDDR等多種數據庫，能提供提供數百萬種有機化合物的信息。這些一流的硬件資源和軟件資源為王任小研究員課題組進行高性能藥物分子設計提供了先進的技術條件。同時，王任小研究員課題組也擁有必要的有機合成以及生物學實驗設備。該課題組依托生命有機化學國家重點實驗室有利的外部環境，積極在有機合成、分子生物學以及結構生物學等方面與其他課題組開展合作。王任小研究員課題組近年來從事抗腫瘤分子靶向藥物的研發，針對Bcl-2蛋白家族等潛在藥物靶標，目前已獲得了多種類型的活性先導化合物，已經申請國家發明專利多項，并在積極將這些先導化合物發展為候選藥物。

在擁有一流的硬件資源和軟件資源、雄厚的科研實力的前提下，王任小研究員正準備廣納賢才，讓更多有志于從事藥物分子設計以及新藥研發的科研人員加入課題組，進一步發展和完善藥物分子設計的理論和方法，研究與重大疾病過程相關的生物靶標，努力攻克新藥創制領域中的難題。

眾多優秀人才齊聚一堂，如何才能最大限度地發揮出每個人的聰明才智和創造能力？王任小研究員表示：取長補短，交流合作是關鍵。做學問不是一個人閉門造車就行的。成功的經驗拿出來分享可以激發出更多的創造靈感，精誠合作才會產生“1+1>2”的效應。王任小研究員課題組內部定期開展小組討論會，交流科研進展。在小組討論會上，課題組成員交流各自的科研進展，討論最新發表的重要論文。許多靈感就是在這樣的思維碰撞中產生的。課題組平時也會組織郊游、休閑和運動等集體活動，一方面使課題組成員在緊張的工作之余得以放松，另一方面也增進了課題組成員之間的和諧關系。王任小研究員課題組正是這樣注重交流、精誠合作、群策群力、銳意進取，從而鑄造出一艘有戰斗力的“科研利艦”，攻克了一個又一個的科研難關。

莘莘年輕學子是科研工作未來的希望。尤其對于新興學科，讓剛剛接觸科研工作的研究生對其產生興趣，進而深入學習和研究，是傳承學科、既往開來的必要環節。王任小研究員以培育英才為己任，以謙虛謹慎的治學態度、一絲不茍的科研精神、追求卓越的崇高理念，以身作則地感染、激勵著課題組中的研究生們。當課題組中每一名研究生順利獲得博士或者碩士學位時，他們總是由衷地感嘆是王老師在過去幾年中給予了他們前進的動力，樹立了他們學習的榜樣。如今，從王任小研究員課題組畢業的學生有些在歐美著名大學或研究機構中繼續深造，有些加盟知名醫藥公司投身新藥創制事業。

“路漫漫其修遠兮，吾將上下而求索”。藥物分子設計研究具有深遠的科學價值以及廣闊的應用前景。王任小研究員憑借他對科學的熱愛，在科研之路上執著前行，必定會攻克重大科學難題，實現他心中的夢想。

文章來源：《科學中國人》2011年第23期