論文專著：
發表學術論文70余篇，出版著作2部。 
出版專著：
1《環境水文學》陳俊合 江濤 陳建耀 科學出版社 2007
2《黃河的水環境問題》陳建耀 華北平原における水動態（7.1）in 福嶌義宏 谷口真人編 株式會社學報社 東京 2008
發表英文論文：
1． Chen JY, 2010. Holistic assessment of groundwater resources and regional environmental problems in the North China Plain. Environmental Earth Sciences, DOI 10.1007/s12665-009-0425-6.
2． Xie LC, Chen JY, Taniguchi M, and Liu GQ, 2010.Comparison of nutrients transport to the sea from the Yellow River and the Pearl River. Proceedings of the 4th Yellow River Forum, Zhengzhou, Vol. II: 173-185
3． Fu CS, Chen JY*, Zeng SQ, Zhao XF, 2009. Analysis of groundwater movements in the coastal watershed in the Southern China- A case study at the Zhuhai Campus of Sun Yat-sen University. In Trend and sustainability of groundwater in highly stressed aquifers (Proceedings of Symposium JS.2 at the Joint IAHS & IAH Convention, Hyderabad, India). IAHS Redbook 329, 130-137.
4． Chen FJ, Jia GD, Chen JY, 2009. Nitrate sources and watershed denitrification inferred from nitrate dual isotopes in the Beijiang River, south China. Biogeochemistry 94: 163-174
5． Chen JY, Fukushima Y, Taniguchi M. 2009. Surface and groundwater interactions in the lower reach of the Yellow River. In From Headwaters to the Ocean- Hydrological changes and watershed management, Taniguchi M, Burnett WC, Fukushima Y, Haigh M, Umezawa Y, CRC Press, Taylor & Francis Group: 301-305
6． Peterson RN, Burnett WC, Taniguchi M, Chen JY, Santos IR, and Misra S, 2008. Determination of transport rates in the Yellow Rive- Bohai Sea mixing zone via natural geochemical tracers. Continental Shelf Research 28: 2700-2707.
7． Peterson RN, Burnett WC, Taniguchi M, Chen JY, Santos IR, and Ishitobi T, 2008. Radon and Radium Isotope Assessment of Submarine Groundwater Discharge in the Yellow River Delta, China, J. Geophys. Res., 113, C9, C09021, doi:10.1029/2008JC004776
8． Taniguchi M, Ishitobi T, Chen JY, Onodera S, Miyaoka K, Burnett WC, Peterson R, Liu GQ, and Fukushima Y, 2008. Submarine groundwater discharge from the Yellow River Delta to the Bohai Sea, China, J. Geophys. Res., 113, C06025, doi:10.1029/2007JC004498
9． Lu YT, Tang CY, Chen JY, Song XF, Li FD, Sakura Y, 2008. Spatial characteristics of water quality, stable isotopes and tritium associated with groundwater flow in the Hutuo River alluvial fan plain of the North China Plan. Hydrogeology Journal 16:1003-1015
10． Zhao XF, Chen FJ, Chen JY*, Tang CY, 2008. Hydrochemical characteristics and evaluation of nitrate contamination in a coastal urban aquifer, Xiangzhou District, Zhuhai City, China. IAHS Redbook 324, 11-17
11． Chen JY, Zhao XF, Tang CY, Lu YT, 2008. Impacts of urbanization and groundwater development on groundwater quality in Guanghua Basin, China. IAHS Redbook 324, 33-40.
12． Lu YT, Tang CY, Chen JY, Sakura Y, 2008. Impact of septic tank on local groundwater quality and water supply in the Pearl River Delta, China: case study. Hydrological Processes, 22:443-450.
13． Chen JY, Taniguchi M, Liu GQ, Miyaoka K, Onodera S, Tokunaga T, Fukushima Y, 2007. Nitrate pollution of groundwater in the Yellow River delta, China. Hydrogeology Journal, 15:1605-1614.
14． Saito M, Onodera S, Miyaoka K, Chen JY, Taniguchi M, Liu GQ, Fukushima Y, 2007. Nitrate contamination in groundwater of the Yellow River Delta and its effect on the marine environment. In Water Quality and Sediment Behaviour of the Future: Predictions for the 21st Century (Proceedings of Symposium HS2005 at IUGG2007, Perugia, July 2007), Webb BW & De Boer D (eds). IAHS Publ. 314, 271-277
15． Chen JY, Fukushima Y, Taniguchi M, 2007. Groundwater and its association with sustainability in the North China Plain. In Changes in Water Resources Systems: Methodology to Maintain Water Security and Ensure Integrated Management, van de Giesen N, Xia J, Rosbjerg D, Fukushima Y (eds). IAHS 315: 258-265.
16． Taniguchi M, Chen JY, Fukushima Y, 2007. The hydrological impact zone in the lower reaches of the Yellow River: a new concept for water resources issues. In Changes in Water Resources Systems: Methodology to Maintain Water Security and Ensure Integrated Management, van de Giesen N, Xia J, Rosbjerg D, Fukushima Y (eds). IAHS 315: 199-205.
17． Chen JY, Fukushima Y, Taniguchi M, 2005. Study on sustainability of irrigation agriculture by diversion in the lower reach of the Yellow River. In Recharging system for protecting and enhancing groundwater resources, Proceedings of 5th International Symposium on Management of Aquifer Recharge, ISMAR5. IHP-VI. Series on Groundwater No. 13, UNESCO: 186-191.
18． Chen JY, Ke D, Zhao XF, Fukushima Y, Taniguchi M, 2006. Characteristics of sediment and nutrient flows in the lower reach of the Yellow River. In Climate variability and change- hydrological impacts, Demuth S, Gustard A, Planos E, Scatena F, Servat E (eds). IAHS Publication 308: 612-616.
19． Chen JY, Tang CY, Yu JJ, 2006. Use of 18O, 2H and 15N to identify nitrate contamination of groundwater in a wastewater irrigated field near the city of Shijiazhuang, China, Journal of Hydrology 326:367-378.
20． Chen JY, Fukushima Y, Taniguchi, M, 2005. Water use and its impact zone in the lower reach of the Yellow River. In Proceedings of the 2nd Yellow River Forum on keeping healthy life of the river, Volume I, Shang H (ed). The Yellow River Conservancy Publishing House, Zhengzhou: 97-106.
21． Chen JY, Tang CY, Sakura S, Yu JJ, Fukushima, Y, 2005. Nitrate pollution from agriculture in different hydrogeological zones of the regional groundwater flow system in the North China Plain, Hydrogeology Journal 13:481-492.
22． Chen JY, Tang CY, Sakura S, Kondoh A, Yu JJ, Shimada J, Tanaka T, 2004. Spatial geochemical and isotopic characteristics associated with groundwater flow in the North China Plain, Hydrological Processes 18: 3133-3146.
23． Chen JY, Tang CY, Fukushima Y, Taniguchi M, 2003. Water environmental problems associated with natural processes and human activities in the lower reach of the Yellow River, In 1st International Yellow River Forum on River Basin Management, Volume IV, Shang H (ed). The Yellow River Conservancy Publishing House, Zhengzhou: 263-274.
24． Chen JY, Tang CY, Sakura S, Kondoh A, Shen YJ and Song XF, 2004. Measurement and analysis of redistribution of soil moisture and salute in a maize field in the lower reach of the Yellow River, Hydrological Processes 18:2263-2273.
25． Shen YJ, Zhang YQ, Kondoh A, Tang CY, Chen JY, Xiao JY, Sakura Y, Liu CM, Sun HY, 2004. Seasonal variation of energy partitioning in irrigated wheat and maize farmland, Hydrological Processes 18: 2223-2234.
26． Tang CY, Chen JY, Shindo S, Sakura Y, Zhang WJ, Shen YJ, 2004. Assessment of groundwater contamination by nitrates associated with wastewater irrigation: A case study from Shijiazhuang region, China, Hydrological Processes 18:2303-2312.
27． Chen JY, Tang CY, Shen YJ, Sakura S, 2003. Use of water balance and calculation and tritium to examine the dropdown of groundwater table in the piedmont of the North China Plain (NCP), Environmental Geology, 44: 564-571
28． Chen JY, Tang CY, Shen YJ, Sakura Y, Kondoh A, 2004. Nitrate pollution of groundwater in a wastewater irrigated field of Hebei Province, In Risk Assessment of Waste Water Re-Use on Groundwater Quality, Joop Steenvoorden (ed.). Red-book of IAHS, 285:23-27
29． Tang CY, Chen JY, Shen YJ, 2004. Long-term effect of wastewater irrigation on nitrate in groundwater in the North China Plain. In Risk Assessment of Waste Water Re-Use on Groundwater Quality, Joop Steenvoorden (ed.). Red-book of IAHS, 285:34-40
30． Chen JY, Tang CY, Sakura S, Shen YJ, 2003. Nitrate pollution in groundwater in the lower reach of the Yellow River, case study in Shandong Province, China. In Groundwater Engineering- Recent Advances, Kono, Nishigaki & Komatsu (eds). A.A.Balkema Publishers. Swets & Zeilinger, Lisse: 279-283.
31． Chen JY, Tang CY, Sakura S, Kondoh A, Shen YJ, 2002. Groundwater flow and geochemistry in the lower reach of the Yellow River: case study in Shandong Province, China, Hydrogeology Journal 10: 587-599.
32． Shen YJ, Kondoh A, Tang CY, Zhang YQ, Chen JY, Li WQ, Sakura Y, Liu CM, Tanaka T, Shimada J. 2002. Measurement and analysis of evapotranspiration and surface conductance of a wheat canopy, Hydrological Processes, Vol. 16, 2173-2187.
33． Chen JY, Tang CY, Sakura S, Kondoh A, Shen YJ and Ouyang Z. 2001. The impacts of diversion from the Yellow River on the local aquifer-case study in Shandong Province, China, In New Approaches Characterizing Groundwater Flow, Seiler KP, Wohnlich S (eds). A.A.Balkema Publishers: Lisse.
34． Chen JY and Liu CM, Coupling of water and land resources and its application in regionalization, Journal of Environmental Sciences, Vol. 11, No.1, 1999
35． Chen JY, The simulation of runoff using time-area graph derived from DTM. ITC Journal 1998-2, the Netherlands
36． Chen JY and Wu K, Preliminary analyses for crop water consumption by using lysimeter, The Journal of Chinese Geography, Vol. 7, No3, 1997
37． Chen, J.Y and C.M. Liu, Quantitative analysis of some issues in urban water resources management, the proceeding of South-East Asia regional workshop for urban hydrology, Hohai Univ. Press, 1997
38． Chen JY, Water shortage and its environmental impacts, proceedings of the International Symposium on Hydro-Environment in Asia, Japan, 1997
發表中文論文：
1 國內外實驗小流域水科學研究綜述 付叢生; 陳建耀; 曾松青; 蔣華波; 董林垚 中山大學地理科學與規劃學院 【期刊】地理科學進展 2011-03-15
2 城鎮化過程中地下水微生物的時空分異與演化——以珠海為例 黃小蘭; 陳建耀; 周世寧; 謝麗純; 蔣華波; 董林垚 中山大學地理科學與規劃學院; 廣西師范學院資源與環境科學學院; 中山大學生命科學學院 【期刊】自然資源學報 2011-03-15
3 珠江三角洲濱海小流域離子化學特征及來源分析 謝麗純; 陳建耀; 董林垚; 蔣華波 中山大學地理科學與規劃學院 【期刊】熱帶地理 2011-03-15
4 不同尺度流域月徑流模擬對比與敏感性分析——以西江流域為例 蔣華波; 陳建耀; 關綺琪; 董林垚; 付叢生 中山大學地理科學與規劃學院 【期刊】亞熱帶資源與環境學報 2011-03-15
5 微生物應用于污水污泥處理的研究 黃小蘭; 陳建耀 中山大學地理科學與規劃學院; 廣西師范學院資源與環境科學學院 【期刊】亞熱帶資源與環境學報 2010-03-15
6 同位素在小流域基流計算中的應用研究 曾松青; 陳建耀; 付叢生 中山大學地理科學與規劃學院水資源與環境研究中心; 廣東省水文局汕頭水文分局 【期刊】水文 2010-04-25
7 利用承壓井水位估算土壤植被蒸散發量 付叢生; 陳建耀; 曾松青; 趙新鋒 中山大學地理科學與規劃學院水資源與環境研究中心; 廣東省水文局汕頭水文分局; 珠海市環境保護監測站 【期刊】自然資源學報 2010-05-15
8 珠三角濱海小流域降雨入滲試驗與模擬研究 付叢生; 陳建耀; 曾松青 中山大學地理科學與規劃學院; 廣東省水文局汕頭水文分局 【期刊】人民長江 2010-05-14
9 珠三角濱海小流域土壤水分吸力及特征曲線研究 付叢生; 陳建耀; 曾松青; 董林垚; 蔣華波 中山大學地理科學與規劃學院; 廣東省水文局汕頭水文分局 【期刊】中國生態農業學報 2010-05-15
10 小流域地下水流微生物空間差異分析 黃小蘭; 陳建耀; 謝麗純; 付叢生; 周世寧 中山大學地理科學與規劃學院; 廣西師范學院資源與環境科學學院; 中山大學生命科學學院 【期刊】環境科學 2010-10-15
11 基于DEM的華南森林小流域月徑流模擬研究 付叢生; 劉竹筠; 陳建耀; 蔣華波; 董林垚 中山大學地理科學與規劃學院水資源與環境研究中心 【期刊】中國農村水利水電 2010-10-15
12 城鎮居民家庭生活源污染物產排特性研究 趙坤榮; 陳建耀; 許振成; 黃海偉; 蔡楠; 楊大勇; 楊劍 中山大學地理科學與規劃學院水資源與環境研究中心; 環境保護部華南環境科學研究所; 中山大學環境科學與工程學院; University of Notre Dame; Civil Engineering and Geological Sciences; 156 Fitzpatrick Hall; Notre Dame; IN46556 【期刊】生態環境學報 2010-09-18
13 城鎮生活源污染物排放與食物消費相互關系研究 趙坤榮; 陳建耀; 王俊能; 許振成; 楊大勇; 楊劍 中山大學地理科學與規劃學院水資源與環境研究中心; 環境保護部華南環境科學研究所; 湖南農業大學資源環境學院; 中山大學環境科學與工程學院 【期刊】生態環境學報 2010-09-18
14 基于原型觀測與DEM的強風化花崗巖小流域水文過程模擬 付叢生; 陳建耀; 曾松青; 蔣華波; 董林垚 中山大學地理科學與規劃學院; 溫州醫學院水域科學與環境生態研究所; 廣東省水文局汕頭水文分局 【期刊】農業工程學報 2010-10-31
15 珠海市海-陸交錯帶水環境原核生物多樣性 黃小蘭; 陳建耀; 周世寧; 謝麗純; 付叢生 中山大學地理科學與規劃學院; 廣西師范學院資源與環境科學學院; 中山大學生命科學學院 【期刊】應用生態學報 2010-02-15
16 多輸入線性模型(MLM/MLPM)用于平原地區地表產匯流研究——以山東省趙牛河為例 陳建耀 中國科學院國家計劃委員會地理研究所 【期刊】地理科學進展 1997-06-30
17 利用大型蒸滲儀分析潛水蒸發對農田蒸散量的影響 陳建耀; 吳凱 中國科學院國家計劃委員會地理研究所 【期刊】地理學報 1997-09-23
18 冬小麥水分耗散特性與農業節水 吳凱; 陳建耀; 謝賢群 中國科學院國家計劃委員會地理研究所 【期刊】地理學報 1997-09-23
19 城市節水潛力估算與用水管理水平評定 陳建耀; 劉昌明 中國科學院地理研究所 【期刊】地理學報 1998-03-23
20 小流域地下水流微生物空間差異分析 黃小蘭; 陳建耀; 謝麗純; 付叢生; 周世寧 中山大學地理科學與規劃學院; 廣西師范學院資源與環境科學學院; 中山大學生命科學學院 【會議】第八屆博士生學術年會論文摘要集 2010-09-16
21 微生物在城市污水污泥處理中的應用 黃小蘭; 陳建耀 中山大學地理科學與規劃學院; 廣西師范學院資源與環境科學學院 【會議】微生物實用技術生態環境應用學術研討會論文集 2008-12-27
22 農業污水灌溉對石家莊市近郊灌區地下水環境的影響 唐常源; 陳建耀; 宋獻方; 張萬軍 日本千葉大學園藝學部; 中山大學地理科學與規劃學院; 中國科學院地理科學與資源研究所陸地水循環及地表過程重點實驗室; 中國科學院遺傳與發育生物學研究所農業資源研究中心 松戶市271-8510千葉縣日本 【期刊】資源科學 2006-01-30
23 地下水硝酸鹽污染研究綜述 陳建耀; 王亞; 張洪波; 趙新峰 中山大學地理科學與規劃學院; 中山大學地理科學與規劃學院; 中山大學地理科學與規劃學院 廣州 【期刊】地理科學進展 2006-01-30
24 石家莊地區近70年來伴隨經濟發展的水文環境變化分析 沈彥俊; 宋獻方; 肖捷穎; 陳建耀; 唐常源 中國科學院遺傳與發育生物學研究所農業資源中心; 中國科學院地理科學與資源研究所陸地水循環及地表過程重點實驗室; 日本千葉大學環境遙感研究中心; 中山大學地理科學與規劃學院; 日本千葉大學園藝學部 石家莊; 日本千葉263-8522; 中國科學院地理科學與資源研究所陸地水循環及地表過程重點實驗室 【期刊】自然資源學報 2007-01-30
25 珠江三角洲小流域地下水化學特征及演化規律 趙新鋒; 陳建耀; 唐常源; 曾松青; 魯垠濤 中山大學地理科學與規劃學院; 中山大學地理科學與規劃學院; 日本千葉大學園藝學部; 日本千葉大學園藝學部松戶市271-8510千葉縣; 廣東廣州; 松戶市271-8510千葉縣 【期刊】生態環境 2007-11-18
26 濱海地區潮汐對地下水位變化影響的統計學分析 付叢生; 陳建耀; 曾松青; 趙新鋒 中山大學地理科學與規劃學院水資源與環境研究中心; 廣東省水文局汕頭水文分局; 珠海市環境保護監測站 【期刊】水利學報 2008-12-15
27 城市地下水硝酸鹽污染及其成因分析——以珠海香洲區為例 趙新鋒; 陳法錦; 陳建耀; 唐常源; 羅穎琳; 賈國東 中山大學地理科學與規劃學院; 中國科學院廣州地球化學研究所有機地球化學國家重點實驗室; 中山大學地理科學與規劃學院; 日本千葉大學園藝學部; 中國科學院廣州地球化學研究所有機地球化學國家重點實驗室 廣州; 松戶271-8510千葉縣 【期刊】水文地質工程地質 2008-05-15
28 “珠三角”地區城市化對地下水水質影響案例研究 趙新鋒; 曾松青; 陳建耀; 唐常源; 羅穎琳 中山大學地理科學與規劃學院; 中山大學地理科學與規劃學院; 日本千葉大學園藝學部; 日本271-8510; 廣東廣州 【期刊】生態環境 2008-03-18
29 區域調水規模的指標體系與PRED綜合論證 陳建耀; 于靜潔 中國科學院地理研究所; 中國科學院地理研究所 【期刊】地理研究 1999-12-25
30 利用大型蒸滲儀模擬土壤-植物-大氣連續體水分蒸散 陳建耀; 劉昌明; 吳凱 中國科學院地理研究所 【期刊】應用生態學報 1999-02-18
31 水資源調配中PRED綜合論證的初步研究 陳建耀; 于靜潔; 劉昌明 日本千葉大學自然科學研究科; 中國科學院地理研究所; 中國科學院地理研究所 【期刊】地理學報 2000-05-23
32 柴達木盆地水資源信息系統研究 陳建耀; 梁季陽; 成立 中國科學院地理研究所; 中國科學院地理研究所 【期刊】水科學進展 2000-03-30
33 城市用水動態模擬與預測模型——以洛陽市為例 陳建耀; 劉昌明 中國科學院、國家計委地理研究所; 中國科學院、國家計委地理研究所 【期刊】水文 1992-05-30
34 水資源管理中幾個問題的探討 陳建耀 中國科學院、國家計劃委員會地理研究所 北京 【期刊】自然資源 1993-10-28
35 城市水資源供需經濟分析與對策 陳建耀 中國科學院國家計委地理研究所 【期刊】資源開發與保護 1990-12-31
36 水資源管理中的水文基礎國際研討會綜述 凌美華; 陳建耀 中國科學院地理研究所; 國家計劃委員會地理研究所 【期刊】地球科學進展 1991-05-01
37 漢字DBASEⅢ用于城市水資源管理系統——以洛陽市為例 陳建耀 中國科學院、國家計委地理研究所 【期刊】地域研究與開發 1991-07-02
科學研究：
榮譽獎勵：
媒體報道：